Le Trichoderma : Allié ou Ennemi ? Comprendre son Rôle en Myciculture

"Dans l’ombre des sous-bois, un champignon discret,
Le Trichoderma, par sa force secrète,
Se mêle aux racines, tissant son destin,
Allié de la vie, ou bien sombre assassin ?

Il nourrit la terre et défend les semis,
Mais gare à ses pas qui parfois sont ennemis.
Dans le cœur des cultures, il garde sa place,
Un mystère vivant que la science enlace.

Plongeons dans son monde, entre bien et danger,
Pour mieux découvrir ce qu’il vient partager.."

Poeme en Alexandrin écrit par notre MycoGuide, le 31/08/24

Le Trichoderma est un genre de champignons microscopiques largement étudié pour ses propriétés bénéfiques et nuisibles. Tandis que les myciculteurs redoutent souvent sa présence comme un contaminant agressif, les agriculteurs biologiques l'apprécient pour ses capacités à stimuler la croissance des plantes et à combattre les maladies.

Cet article explore le double rôle du Trichoderma : un problème majeur en myciculture et un allié précieux en agriculture biologique et raisonnée. Nous discuterons de sa nature, de son cycle de vie, des moyens de prévenir sa contamination en myciculture, et de son utilisation efficace en agriculture.

1. Qu'est-ce que le Trichoderma ?

Définition et Classification

Le Trichoderma est un genre de champignons filamenteux appartenant à la famille des Hypocreaceae. Ce genre comprend de nombreuses espèces, parmi lesquelles Trichoderma harzianum, Trichoderma virens, et Trichoderma atroviride sont les plus connues et étudiées.

Les champignons de ce genre se caractérisent par une croissance rapide et la production de conidies vertes lorsqu'ils se développent sur un substrat. Ces champignons sont largement présents dans divers environnements, notamment les sols forestiers, les débris de bois, et les matières organiques en décomposition.

Rôle dans la Nature

Dans la nature, le Trichoderma est principalement saprophyte, c’est-à-dire qu’il décompose la matière organique morte, jouant un rôle crucial dans le cycle des nutriments. Certaines espèces de Trichoderma ont également un comportement symbiotique ou parasitique, colonisant les racines des plantes ou s'attaquant à d'autres champignons pathogènes.

Cette capacité à coloniser différents environnements rend le Trichoderma très adaptable et efficace pour contrôler les populations microbiennes.

Cycle de Vie du Trichoderma

Le cycle de vie du Trichoderma comprend plusieurs étapes :

1. Germination des Spores : Les conidies, ou spores asexuées, germent lorsque les conditions de température, d'humidité, et de disponibilité des nutriments sont favorables.
2. Croissance Mycélienne : Après la germination, le mycélium se développe rapidement en formant un réseau dense de filaments. Cette croissance est particulièrement efficace dans des environnements riches en matières organiques.
3. Production de Conidies : Une fois que le mycélium est établi, le champignon produit des conidies pour se reproduire et se disperser. Ces spores peuvent survivre dans des conditions difficiles jusqu'à ce qu'elles trouvent un nouvel environnement favorable pour germer.
4. Dispersion et Colonisation : Les conidies sont dispersées par le vent, l'eau, ou les animaux, colonisant de nouveaux substrats et recommençant le cycle.

Les adaptations écologiques du Trichoderma, telles que sa capacité à décomposer la cellulose et d'autres composés organiques complexes, lui confèrent un avantage compétitif dans divers environnements.

2. Trichoderma en Myciculture : Un Contaminant Redouté

Pourquoi le Trichoderma est-il un problème ?

En myciculture, le Trichoderma que l'on appelle aussi souvent "la moisissure verte" est souvent perçu comme un contaminant majeur. Sa présence dans les cultures de champignons comestibles ou médicinaux peut entraîner des pertes économiques importantes.

Le Trichoderma se développe rapidement et entre en compétition directe avec le mycélium des champignons cultivés pour les nutriments et l'espace, inhibant leur croissance et entraînant souvent la destruction totale du substrat.

Comment le Trichoderma contamine-t-il les cultures de champignons ?

Le Trichoderma peut contaminer les cultures de champignons par plusieurs vecteurs :

• L'air : Les spores de Trichoderma peuvent être transportées par l'air et se déposer sur les substrats ou les cultures.

• Le substrat : Un substrat mal préparé ou mal pasteurisé peut contenir des spores de Trichoderma.

• Le cultivateur : Les mains, les vêtements ou les outils du cultivateur peuvent transférer des spores de Trichoderma aux cultures.

• Les mouches et autres insectes : Ces insectes peuvent transporter des spores et les déposer sur les cultures.

• Les unités mobiles de contamination : Cela inclut tout équipement mobile ou matériel qui entre en contact avec le substrat ou la culture.

Prévention et Contrôle des Contaminations au Trichoderma

Le Trichoderma est un contaminant courant en myciculture, et sa présence peut gravement affecter la production de champignons. La prévention et le contrôle des contaminations sont donc essentiels pour maintenir un environnement de culture sain.

A. Pasteurisation et Stérilisation des Substrats

Températures et Méthodes de Traitement :

• Pasteurisation : La pasteurisation consiste à chauffer les substrats à des températures spécifiques (généralement entre 60°C et 80°C) pendant 1 à 2 heures. Cette méthode élimine la majorité des agents pathogènes, y compris certains spores de Trichoderma, tout en préservant les microorganismes bénéfiques qui aident à la croissance des champignons.
• Stérilisation : Pour une élimination complète des contaminants, la stérilisation des substrats est réalisée à des températures plus élevées, généralement à 121°C pendant au moins 30 minutes sous pression (autoclave). Cela détruit tous les microorganismes, y compris les spores de Trichoderma. Cependant, après la stérilisation, il est crucial de maintenir des pratiques aseptiques strictes pour éviter toute recontamination. Les manipulations doivent se faire dans un environnement stérile (flux laminaire, utilisation de gants, masques, etc.) pour prévenir l'introduction de spores de Trichoderma ou d'autres contaminants.

Précautions après Pasteurisation ou Stérilisation :

• Une fois les substrats pasteurisés ou stérilisés, ils doivent être manipulés avec soin pour éviter la recontamination. L'utilisation d'outils stériles et le maintien de l'environnement de travail propre et aseptique sont essentiels. Les surfaces de travail doivent être désinfectées régulièrement, et l'air ambiant doit être filtré pour réduire la charge microbienne.

B. Environnements de Travail Contrôlés

Utilisation de Salles de Culture Propres et de Flux Laminaire :

• Les myciculteurs doivent travailler dans des environnements contrôlés, tels que des salles de culture propres et stériles, équipées de systèmes de flux laminaire pour filtrer l'air et empêcher l'entrée de contaminants aériens. Les spores de Trichoderma peuvent être transportées par l'air, d'où l'importance de maintenir un environnement de travail sous pression positive avec des filtres HEPA.

UVC comme Méthode de Prévention :

• L'utilisation de lampes à ultraviolets (UVC) dans les salles de culture peut être utile pour réduire la charge microbienne, y compris les spores de Trichoderma, sur les surfaces et dans l'air. Cependant, il est important de noter que l'exposition directe des champignons aux rayons UVC peut également les endommager. Les UVC doivent donc être utilisés en l'absence de cultures vivantes ou dans des zones spécifiques de désinfection.

C. Que Faire en Cas de Contamination par des Moisissures Vertes pendant la Fructification ?

Si des moisissures vertes, indiquant généralement une infestation par Trichoderma, apparaissent pendant la phase de fructification des ballots de culture, plusieurs mesures peuvent être prises :

• Retrait des Parties Contaminées : Dès l'apparition des premières taches vertes, il est essentiel de retirer immédiatement les parties contaminées des ballots. Utilisez un couteau stérilisé ou des ciseaux pour découper soigneusement la zone affectée, en veillant à ne pas disperser les spores.

• Utilisation de Sel : Saupoudrer du sel sur les zones contaminées après avoir retiré les parties infectées peut aider à limiter la propagation de la moisissure. Le sel dessèche les cellules fongiques et peut empêcher la croissance ultérieure de Trichoderma.

• Isolation des Ballots Contaminés : Les ballots de culture contaminés doivent être isolés des autres pour éviter la propagation des spores. Un espace bien ventilé avec une bonne circulation d'air peut également aider à réduire l'humidité, rendant l'environnement moins favorable à la croissance de Trichoderma.

• Amélioration des Conditions de Culture : Assurez-vous que les conditions de culture (humidité, température, ventilation) sont optimales pour les champignons et non favorables à la croissance de Trichoderma. Maintenez une surveillance constante et ajustez les conditions si nécessaire.

• Le nettoyage régulier du sol et des surfaces va permettre de limiter l'accumulation de spores.

En suivant ces pratiques rigoureuses de prévention et de contrôle, les myciculteurs peuvent minimiser les risques de contamination par le Trichoderma et garantir une production de champignons saine et de haute qualité.

Conidiophores de Trichoderma harzianum (src: wikipedia)

3. Trichoderma en Agriculture : Un Outil Puissant pour la Culture Raisonnée

Pourquoi Utiliser le Trichoderma en Agriculture ?

Le Trichoderma est utilisé en agriculture principalement pour ses propriétés de biocontrôle et de stimulation de croissance des plantes. Les champignons Trichoderma peuvent parasiter d'autres champignons pathogènes et libérer des composés antifongiques naturels qui protègent les cultures. De plus, ils induisent la résistance des plantes en stimulant la production de composés de défense.

Les Avantages du Trichoderma en Agriculture Biologique

1. Amélioration de la Santé du Sol : En décomposant la matière organique, le Trichoderma contribue à la formation de l'humus et à la libération de nutriments essentiels pour les plantes.
2. Stimulation du Microbiome Racinaire : En colonisant la rhizosphère (zone autour des racines), le Trichoderma favorise la croissance des plantes en améliorant l'absorption des nutriments.
3. Réduction des Pathogènes : Son action mycoparasitaire contre des pathogènes comme le Fusarium et le Pythium en fait un choix privilégié pour le biocontrôle.

Comment Utiliser le Trichoderma ?

• Enrobage des Semences : Les semences peuvent être traitées avec une suspension de Trichoderma pour protéger les jeunes plants dès la germination.
• Pulvérisation Foliaire et Application au Sol : Une solution de Trichoderma diluée peut être pulvérisée sur le feuillage pour prévenir les maladies cryptogamiques, ou appliquée au sol pour améliorer la santé des racines.

Recette Pratique pour les Particuliers : Cultiver et Utiliser du Trichoderma

Étape 1 : Préparer un Sac de Grains Stérilisés

Pour commencer, procurez-vous un sac de grains stérilisés disponible sur notre boutique en ligne : Sac de Grains Stérilisés - Mycosphere. Vous pouvez l’inoculer avec une souche de Trichoderma que vous avez déjà à disposition, ou simplement suivre l'une des méthodes suivantes pour favoriser la croissance naturelle du Trichoderma :

1. Inoculation Contrôlée : Si vous disposez d’une souche de Trichoderma (achetée ou cultivée), introduisez-la dans le sac de grains stérilisés. Cela garantit une culture plus pure et efficace.

2. Méthode Naturelle : Si vous n’avez pas de souche de Trichoderma sous la main, ouvrez simplement le sac à l'air libre pendant environ 5 minutes. Les spores de Trichoderma, souvent présentes dans l'air, auront 90% de chances de coloniser le substrat. Pour augmenter encore les chances, vous pouvez ajouter une petite pincée de terre du jardin dans le sac. Cette méthode est moins fiable que l'inoculation directe avec une souche sélectionnée, mais elle peut tout de même fonctionner dans la plupart des cas.

Étape 2: Laisser le Trichoderma Coloniser le Sac

• Après l'inoculation (contrôlée ou naturelle), fermez hermétiquement le sac et placez-le dans un endroit sombre et à température ambiante (entre 20°C et 25°C).
• Attendez environ 7 à 10 jours. Pendant cette période, le Trichoderma devrait commencer à coloniser les grains, formant une masse verte et blanche. Une fois que la majorité des grains sont colonisés, ils sont prêts à être utilisés.

Étape 3 : Préparation de la Solution de Spores de Trichoderma

1. Recouvrir les Grains d'Eau : Ouvrez le sac de grains colonisés et transférez-les dans un grand récipient propre. Recouvrez les grains d'eau pure (de préférence filtrée ou distillée).

2. Séparation des Spores : Laissez les grains reposer dans l'eau pendant environ 10 minutes, en remuant doucement et en retournant régulièrement pour aider à libérer les spores de Trichoderma dans l'eau.

3. Filtrage : Après 10 minutes, filtrez le mélange à l'aide d'une passoire fine ou d'un tamis. Retenez les grains dans la passoire et ne gardez que le liquide vert qui contient les spores en suspension. Ce liquide vert est maintenant riche en spores de Trichoderma.

4. Stockage : Versez le liquide filtré dans des bouteilles propres et hermétiques. Fermez les bouteilles et stockez-les dans un endroit frais, à l’abri de la lumière. Les spores de Trichoderma peuvent rester viables pendant plusieurs semaines lorsqu’elles sont conservées correctement.

Étape 4 : Application de la Solution de Trichoderma

• Dilution : Avant de l'utiliser, diluez le liquide de spores de Trichoderma dans de l'eau à raison de 1:20 (1 part de solution de spores pour 20 parts d'eau). Par exemple, pour 1 litre de solution de spores, ajoutez 20 litres d'eau.
• Pulvérisation : Utilisez cette solution diluée pour pulvériser directement sur le feuillage des plantes ou au niveau du sol autour des racines. Cette application aide à prévenir et contrôler les maladies fongiques, tout en favorisant une croissance saine des plantes.

4. Les Espèces de Trichoderma Utilisées en Agriculture

Espèces Communes Utilisées

L'espèce la plus couramment utilisée est le Trichoderma harzianum, connue pour son efficacité contre un large éventail de pathogènes du sol. D'autres espèces, telles que Trichoderma virens et Trichoderma atroviride, sont également utilisées selon les conditions spécifiques et les types de cultures.

Comment Choisir la Bonne Souche ?

La sélection de la souche appropriée dépend de nombreux facteurs, tels que le type de culture, les conditions du sol, et les pathogènes présents. Par exemple, certaines souches de T. harzianum sont plus efficaces contre les maladies des plantes dans des sols à pH neutre à légèrement acide.

5. Le Potentiel Inexploré du Trichoderma et Innovations Futures

Nouvelles Applications en Développement

Outre l'agriculture, le Trichoderma a un potentiel en bioremédiation des sols contaminés par des métaux lourds ou des pesticides. Son utilisation dans les systèmes d'agriculture urbaine et hydroponique est également explorée, où il peut aider à gérer les maladies sans produits chimiques.

Développements Scientifiques et Innovations

Des recherches récentes se concentrent sur l’amélioration génétique du Trichoderma pour augmenter sa résistance et son efficacité. Des projets visent également à combiner plusieurs souches pour obtenir des résultats plus robustes.

Conclusion

Le Trichoderma représente à la fois un défi et une opportunité selon son usage. En myciculture, il est essentiel de le gérer pour éviter des pertes, tandis qu’en agriculture biologique, il offre un outil naturel et efficace pour stimuler les cultures et contrôler les maladies.

Grâce à une meilleure compréhension et à des innovations continues, le Trichoderma pourrait jouer un rôle clé dans l'agriculture durable de demain.

Références et Sources

1. Harman, G. E., et al. (2004). "Trichoderma species—Opportunistic, avirulent plant symbionts." Nature Reviews Microbiology.
2. Vinale, F., et al. (2008). "Trichoderma–plant–pathogen interactions." Soil Biology and Biochemistry.
3. Kubicek, C. P., et al. (2011). "Trichoderma: Biology and Applications." Wiley-Blackwell.
4. https://www.researchgate.net/figure/Graphical-diagram-representing-the-beneficial-roles-of-Trichoderma-spp-in-cherry-tomato_fig5_365618382